在自來水公司尚未成立前，稱為鳳萬聯合水廠，隸屬鳳林鎮公所建設課，所轄供水系統鳳林、北林、西林、萬里等四個系統。
63年10月成立自來水公司改稱鳳林營運所91年1月合併光復營運所 ，91年10月接管瑞穗營運所富源系統，合計有鳳林、光復、富源、豐濱、港口等五個系統；平均每日總出水量約15,000CMD。

為因應鳳林鎮及光復鄉供水穩定，於95年間完成淨水場擴建支亞干淨水場，其水源取至水質清澈無污染之北清水溪地面水，豐水期設計出水量為20,000CMD。供水區域為鳳林鎮全鎮鄉、光復鄉全鄉(大豐、大富、大興村除外)萬榮鄉西林見晴明利及壽豐鄉米棧村等地區。

支亞干淨水場設有完整之混合池、快混池、慢混池、沉澱池、快濾池、加藥設備等淨水處理單元，且其均已納入電腦自動監視及控制，提供量足質優自來水，確保用水健康安全，提昇用戶生活品質。