本處水質課位於新北市三峽區復興路551號(電話：02-2672-3542)，於84年度取得行政院環境保護署環境檢驗測定機構「飲用水檢測類」設置許可證，建立本處水質檢驗之公信力，並於85年度取得「水質水量檢測類」設置許可證，辦理廢水檢驗業務；接續展延及各檢項報告簽署人之認證直至103年6月9日止。
另為了提升自主管理及檢驗數據品質與國際接軌，於104年7月10日取得財團法人全國認證基金會（TAF）實驗室認證。認可的範圍為TAF之生物及化學測試領域，檢測項目包括總菌落數、大腸桿菌群、pＨ值/酸鹼度(含遊測)、自由有效餘氯(含遊測)、硝酸鹽氮、氯鹽、硫酸鹽、亞硝酸鹽氮、濁度、總硬度及氟鹽等總共11項。
行政院環保署及新北市環境保護局對本處飲用水進行例行查核及不定期抽測，近年來本處經檢測結果各項水質均符合「飲用水水源水質標準」及「飲用水水質標準」。
另為了提升自主管理及檢驗數據品質與國際接軌，於104年7月10日取得財團法人全國認證基金會（TAF）實驗室認證。認可的範圍為TAF之生物及化學測試領域，檢測項目包括總菌落數、大腸桿菌群、pＨ值/酸鹼度(含遊測)、自由有效餘氯(含遊測)、硝酸鹽氮、氯鹽、硫酸鹽、亞硝酸鹽氮、濁度、總硬度及氟鹽等總共11項。
行政院環保署及新北市環境保護局對本處飲用水進行例行查核及不定期抽測，近年來本處經檢測結果各項水質均符合「飲用水水源水質標準」及「飲用水水質標準」。